Skip to content

rm MANIFEST.in #2739

New issue

Have a question about this project? Sign up for a free GitHub account to open an issue and contact its maintainers and the community.

By clicking “Sign up for GitHub”, you agree to our terms of service and privacy statement. We’ll occasionally send you account related emails.

Already on GitHub? Sign in to your account

Merged
merged 2 commits into from
Nov 18, 2022
Merged

rm MANIFEST.in #2739

merged 2 commits into from
Nov 18, 2022

Conversation

janosh
Copy link
Member

@janosh janosh commented Nov 18, 2022

Following discussion in #2738 (comment), this PR removes the MANIFEST.in file since it pulled a lot of unnecessary files like .mypy_cache and docs/*, docs_rst/*, dev_scripts/ into the source distribution. It's job is taken over by setup.py with slight modifications.

Old `SOURCES.txt` (1452 lines after removing `.mypy_cache` lines
.gitattributes
.gitignore
.pre-commit-config.yaml
CHANGES.rst
CITATION.cff
CONTRIBUTING.rst
LICENSE.rst
MANIFEST.in
README.md
SECURITY.md
metadata.yml
pylintrc
pyproject.toml
setup.cfg
setup.py
tasks.py
.github/PULL_REQUEST_TEMPLATE.md
.github/dependabot.yml
.github/ISSUE_TEMPLATE/bug_report.md
.github/ISSUE_TEMPLATE/feature_request.md
.github/workflows/lint.yml
.github/workflows/test.yml
cmd_line/bader/Linux_64bit/bader
cmd_line/boltztrap/Darwin_64bit/BoltzTraP
cmd_line/boltztrap/Darwin_64bit/x_trans
cmd_line/boltztrap/Linux_64bit/x_trans
cmd_line/enum/README
cmd_line/enum/Linux_64bit/enum.x
cmd_line/enum/Linux_64bit/makestr.x
cmd_line/gulp/Libraries/belashchenko.lib
cmd_line/gulp/Libraries/bks.lib
cmd_line/gulp/Libraries/bresme_water.lib
cmd_line/gulp/Libraries/bush.lib
cmd_line/gulp/Libraries/carbonate.lib
cmd_line/gulp/Libraries/catlow.lib
cmd_line/gulp/Libraries/clayFF.lib
cmd_line/gulp/Libraries/clerirosato.lib
cmd_line/gulp/Libraries/dreiding.lib
cmd_line/gulp/Libraries/dreiding_paper.lib
cmd_line/gulp/Libraries/edip_marks.lib
cmd_line/gulp/Libraries/eledata
cmd_line/gulp/Libraries/ffsioh.lib
cmd_line/gulp/Libraries/finnissinclair.lib
cmd_line/gulp/Libraries/garofalini.lib
cmd_line/gulp/Libraries/glue.lib
cmd_line/gulp/Libraries/johnson.lib
cmd_line/gulp/Libraries/kornyshev.lib
cmd_line/gulp/Libraries/lewis.lib
cmd_line/gulp/Libraries/meam_1nn.lib
cmd_line/gulp/Libraries/meidavenport.lib
cmd_line/gulp/Libraries/mox.lib
cmd_line/gulp/Libraries/old-clayFF.lib
cmd_line/gulp/Libraries/reaxff.lib
cmd_line/gulp/Libraries/reaxff_auoh.lib
cmd_line/gulp/Libraries/reaxff_ausch.lib
cmd_line/gulp/Libraries/reaxff_bazro3.lib
cmd_line/gulp/Libraries/reaxff_feoh.lib
cmd_line/gulp/Libraries/reaxff_general.lib
cmd_line/gulp/Libraries/reaxff_oxidative.lib
cmd_line/gulp/Libraries/reaxff_sicho.lib
cmd_line/gulp/Libraries/reaxff_sio2.lib
cmd_line/gulp/Libraries/reaxff_siohna.lib
cmd_line/gulp/Libraries/reaxff_zno.lib
cmd_line/gulp/Libraries/streitzmintmire.lib
cmd_line/gulp/Libraries/suttonchen.lib
cmd_line/gulp/Libraries/tersoff.lib
cmd_line/gulp/Libraries/uff.lib
cmd_line/gulp/Libraries/vashishta.lib
cmd_line/gulp/Libraries/vbo.lib
cmd_line/gulp/Linux_64bit/gulp
cmd_line/packmol/Linux_64bit/packmol
dev_scripts/NIST Atomic Ionization Energies Output.html
dev_scripts/Shannon Radii.xlsx
dev_scripts/bond_lengths.yaml
dev_scripts/bvparm2011
dev_scripts/ionic_radii.csv
dev_scripts/nist_codata.txt
dev_scripts/oxidation_states.txt
dev_scripts/periodic_table.db
dev_scripts/periodic_table.yaml
dev_scripts/radii.csv
dev_scripts/regen_libxcfunc.py
dev_scripts/update_pt_data.py
dev_scripts/chemenv/check_new_coordination_geometry.py
dev_scripts/chemenv/equivalent_indices.py
dev_scripts/chemenv/explicit_permutations.py
dev_scripts/chemenv/explicit_permutations_plane_algorithm.py
dev_scripts/chemenv/get_plane_permutations_optimized.py
dev_scripts/chemenv/plane_multiplicity.py
dev_scripts/chemenv/test_algos.py
dev_scripts/chemenv/test_algos_all_geoms.py
dev_scripts/chemenv/view_environment.py
dev_scripts/chemenv/strategies/ce_pairs.json
dev_scripts/chemenv/strategies/multi_weights_strategy_parameters.py
docs/.nojekyll
docs/CNAME
docs/addons.html
docs/change_log.html
docs/compatibility.html
docs/contributing.html
docs/genindex.html
docs/index.html
docs/installation.html
docs/introduction.html
docs/latest_changes.html
docs/modules.html
docs/objects.inv
docs/py-modindex.html
docs/pymatgen.alchemy.filters.html
docs/pymatgen.alchemy.html
docs/pymatgen.alchemy.materials.html
docs/pymatgen.alchemy.transmuters.html
docs/pymatgen.analysis.adsorption.html
docs/pymatgen.analysis.bond_dissociation.html
docs/pymatgen.analysis.bond_valence.html
docs/pymatgen.analysis.chemenv.connectivity.connected_components.html
docs/pymatgen.analysis.chemenv.connectivity.connectivity_finder.html
docs/pymatgen.analysis.chemenv.connectivity.environment_nodes.html
docs/pymatgen.analysis.chemenv.connectivity.html
docs/pymatgen.analysis.chemenv.connectivity.structure_connectivity.html
docs/pymatgen.analysis.chemenv.coordination_environments.chemenv_strategies.html
docs/pymatgen.analysis.chemenv.coordination_environments.coordination_geometries.html
docs/pymatgen.analysis.chemenv.coordination_environments.coordination_geometries_files.html
docs/pymatgen.analysis.chemenv.coordination_environments.coordination_geometry_finder.html
docs/pymatgen.analysis.chemenv.coordination_environments.html
docs/pymatgen.analysis.chemenv.coordination_environments.structure_environments.html
docs/pymatgen.analysis.chemenv.coordination_environments.voronoi.html
docs/pymatgen.analysis.chemenv.html
docs/pymatgen.analysis.chemenv.utils.chemenv_config.html
docs/pymatgen.analysis.chemenv.utils.chemenv_errors.html
docs/pymatgen.analysis.chemenv.utils.coordination_geometry_utils.html
docs/pymatgen.analysis.chemenv.utils.defs_utils.html
docs/pymatgen.analysis.chemenv.utils.func_utils.html
docs/pymatgen.analysis.chemenv.utils.graph_utils.html
docs/pymatgen.analysis.chemenv.utils.html
docs/pymatgen.analysis.chemenv.utils.math_utils.html
docs/pymatgen.analysis.chemenv.utils.scripts_utils.html
docs/pymatgen.analysis.chempot_diagram.html
docs/pymatgen.analysis.cost.html
docs/pymatgen.analysis.diffraction.core.html
docs/pymatgen.analysis.diffraction.html
docs/pymatgen.analysis.diffraction.neutron.html
docs/pymatgen.analysis.diffraction.tem.html
docs/pymatgen.analysis.diffraction.xrd.html
docs/pymatgen.analysis.dimensionality.html
docs/pymatgen.analysis.disorder.html
docs/pymatgen.analysis.elasticity.elastic.html
docs/pymatgen.analysis.elasticity.html
docs/pymatgen.analysis.elasticity.strain.html
docs/pymatgen.analysis.elasticity.stress.html
docs/pymatgen.analysis.energy_models.html
docs/pymatgen.analysis.eos.html
docs/pymatgen.analysis.ewald.html
docs/pymatgen.analysis.excitation.html
docs/pymatgen.analysis.ferroelectricity.html
docs/pymatgen.analysis.ferroelectricity.polarization.html
docs/pymatgen.analysis.fragmenter.html
docs/pymatgen.analysis.functional_groups.html
docs/pymatgen.analysis.gb.grain.html
docs/pymatgen.analysis.gb.html
docs/pymatgen.analysis.graphs.html
docs/pymatgen.analysis.hhi.html
docs/pymatgen.analysis.html
docs/pymatgen.analysis.interface.html
docs/pymatgen.analysis.interface_reactions.html
docs/pymatgen.analysis.interfaces.coherent_interfaces.html
docs/pymatgen.analysis.interfaces.html
docs/pymatgen.analysis.interfaces.substrate_analyzer.html
docs/pymatgen.analysis.interfaces.zsl.html
docs/pymatgen.analysis.local_env.html
docs/pymatgen.analysis.magnetism.analyzer.html
docs/pymatgen.analysis.magnetism.heisenberg.html
docs/pymatgen.analysis.magnetism.html
docs/pymatgen.analysis.magnetism.jahnteller.html
docs/pymatgen.analysis.molecule_matcher.html
docs/pymatgen.analysis.molecule_structure_comparator.html
docs/pymatgen.analysis.nmr.html
docs/pymatgen.analysis.path_finder.html
docs/pymatgen.analysis.phase_diagram.html
docs/pymatgen.analysis.piezo.html
docs/pymatgen.analysis.piezo_sensitivity.html
docs/pymatgen.analysis.pourbaix_diagram.html
docs/pymatgen.analysis.prototypes.html
docs/pymatgen.analysis.quasiharmonic.html
docs/pymatgen.analysis.reaction_calculator.html
docs/pymatgen.analysis.solar.html
docs/pymatgen.analysis.solar.slme.html
docs/pymatgen.analysis.structure_analyzer.html
docs/pymatgen.analysis.structure_matcher.html
docs/pymatgen.analysis.structure_prediction.dopant_predictor.html
docs/pymatgen.analysis.structure_prediction.html
docs/pymatgen.analysis.structure_prediction.substitution_probability.html
docs/pymatgen.analysis.structure_prediction.substitutor.html
docs/pymatgen.analysis.structure_prediction.volume_predictor.html
docs/pymatgen.analysis.substrate_analyzer.html
docs/pymatgen.analysis.surface_analysis.html
docs/pymatgen.analysis.thermochemistry.html
docs/pymatgen.analysis.topological.html
docs/pymatgen.analysis.topological.spillage.html
docs/pymatgen.analysis.transition_state.html
docs/pymatgen.analysis.wulff.html
docs/pymatgen.analysis.xas.html
docs/pymatgen.analysis.xas.spectrum.html
docs/pymatgen.analysis.xps.html
docs/pymatgen.apps.battery.analyzer.html
docs/pymatgen.apps.battery.battery_abc.html
docs/pymatgen.apps.battery.conversion_battery.html
docs/pymatgen.apps.battery.html
docs/pymatgen.apps.battery.insertion_battery.html
docs/pymatgen.apps.battery.plotter.html
docs/pymatgen.apps.borg.hive.html
docs/pymatgen.apps.borg.html
docs/pymatgen.apps.borg.queen.html
docs/pymatgen.apps.html
docs/pymatgen.cli.feff_plot_cross_section.html
docs/pymatgen.cli.feff_plot_dos.html
docs/pymatgen.cli.gaussian_analyzer.html
docs/pymatgen.cli.get_environment.html
docs/pymatgen.cli.html
docs/pymatgen.cli.pmg.html
docs/pymatgen.cli.pmg_analyze.html
docs/pymatgen.cli.pmg_config.html
docs/pymatgen.cli.pmg_plot.html
docs/pymatgen.cli.pmg_potcar.html
docs/pymatgen.cli.pmg_query.html
docs/pymatgen.cli.pmg_structure.html
docs/pymatgen.command_line.bader_caller.html
docs/pymatgen.command_line.chargemol_caller.html
docs/pymatgen.command_line.critic2_caller.html
docs/pymatgen.command_line.enumlib_caller.html
docs/pymatgen.command_line.gulp_caller.html
docs/pymatgen.command_line.html
docs/pymatgen.command_line.mcsqs_caller.html
docs/pymatgen.command_line.vampire_caller.html
docs/pymatgen.core.bonds.html
docs/pymatgen.core.composition.html
docs/pymatgen.core.html
docs/pymatgen.core.interface.html
docs/pymatgen.core.ion.html
docs/pymatgen.core.lattice.html
docs/pymatgen.core.libxcfunc.html
docs/pymatgen.core.molecular_orbitals.html
docs/pymatgen.core.operations.html
docs/pymatgen.core.periodic_table.html
docs/pymatgen.core.sites.html
docs/pymatgen.core.spectrum.html
docs/pymatgen.core.structure.html
docs/pymatgen.core.surface.html
docs/pymatgen.core.tensors.html
docs/pymatgen.core.trajectory.html
docs/pymatgen.core.units.html
docs/pymatgen.core.xcfunc.html
docs/pymatgen.dao.html
docs/pymatgen.electronic_structure.bandstructure.html
docs/pymatgen.electronic_structure.boltztrap.html
docs/pymatgen.electronic_structure.boltztrap2.html
docs/pymatgen.electronic_structure.cohp.html
docs/pymatgen.electronic_structure.core.html
docs/pymatgen.electronic_structure.dos.html
docs/pymatgen.electronic_structure.html
docs/pymatgen.electronic_structure.plotter.html
docs/pymatgen.entries.compatibility.html
docs/pymatgen.entries.computed_entries.html
docs/pymatgen.entries.correction_calculator.html
docs/pymatgen.entries.entry_tools.html
docs/pymatgen.entries.exp_entries.html
docs/pymatgen.entries.html
docs/pymatgen.entries.mixing_scheme.html
docs/pymatgen.ext.cod.html
docs/pymatgen.ext.html
docs/pymatgen.ext.matproj.html
docs/pymatgen.ext.optimade.html
docs/pymatgen.html
docs/pymatgen.io.abinit.abiobjects.html
docs/pymatgen.io.abinit.abitimer.html
docs/pymatgen.io.abinit.html
docs/pymatgen.io.abinit.inputs.html
docs/pymatgen.io.abinit.netcdf.html
docs/pymatgen.io.abinit.pseudos.html
docs/pymatgen.io.abinit.variable.html
docs/pymatgen.io.adf.html
docs/pymatgen.io.ase.html
docs/pymatgen.io.atat.html
docs/pymatgen.io.babel.html
docs/pymatgen.io.cif.html
docs/pymatgen.io.core.html
docs/pymatgen.io.cp2k.html
docs/pymatgen.io.cp2k.inputs.html
docs/pymatgen.io.cp2k.outputs.html
docs/pymatgen.io.cp2k.sets.html
docs/pymatgen.io.cp2k.utils.html
docs/pymatgen.io.cssr.html
docs/pymatgen.io.cube.html
docs/pymatgen.io.exciting.html
docs/pymatgen.io.exciting.inputs.html
docs/pymatgen.io.feff.html
docs/pymatgen.io.feff.inputs.html
docs/pymatgen.io.feff.outputs.html
docs/pymatgen.io.feff.sets.html
docs/pymatgen.io.fiesta.html
docs/pymatgen.io.gaussian.html
docs/pymatgen.io.html
docs/pymatgen.io.jarvis.html
docs/pymatgen.io.lammps.data.html
docs/pymatgen.io.lammps.html
docs/pymatgen.io.lammps.inputs.html
docs/pymatgen.io.lammps.outputs.html
docs/pymatgen.io.lammps.utils.html
docs/pymatgen.io.lmto.html
docs/pymatgen.io.lobster.html
docs/pymatgen.io.lobster.inputs.html
docs/pymatgen.io.lobster.lobsterenv.html
docs/pymatgen.io.lobster.outputs.html
docs/pymatgen.io.nwchem.html
docs/pymatgen.io.packmol.html
docs/pymatgen.io.phonopy.html
docs/pymatgen.io.prismatic.html
docs/pymatgen.io.pwscf.html
docs/pymatgen.io.qchem.html
docs/pymatgen.io.qchem.inputs.html
docs/pymatgen.io.qchem.outputs.html
docs/pymatgen.io.qchem.sets.html
docs/pymatgen.io.qchem.utils.html
docs/pymatgen.io.res.html
docs/pymatgen.io.shengbte.html
docs/pymatgen.io.template.html
docs/pymatgen.io.vasp.help.html
docs/pymatgen.io.vasp.html
docs/pymatgen.io.vasp.inputs.html
docs/pymatgen.io.vasp.optics.html
docs/pymatgen.io.vasp.outputs.html
docs/pymatgen.io.vasp.sets.html
docs/pymatgen.io.wannier90.html
docs/pymatgen.io.xcrysden.html
docs/pymatgen.io.xr.html
docs/pymatgen.io.xtb.html
docs/pymatgen.io.xtb.inputs.html
docs/pymatgen.io.xtb.outputs.html
docs/pymatgen.io.xyz.html
docs/pymatgen.io.zeopp.html
docs/pymatgen.optimization.html
docs/pymatgen.optimization.linear_assignment.html
docs/pymatgen.optimization.linear_assignment_numpy.html
docs/pymatgen.optimization.neighbors.html
docs/pymatgen.phonon.bandstructure.html
docs/pymatgen.phonon.dos.html
docs/pymatgen.phonon.gruneisen.html
docs/pymatgen.phonon.html
docs/pymatgen.phonon.ir_spectra.html
docs/pymatgen.phonon.plotter.html
docs/pymatgen.phonon.thermal_displacements.html
docs/pymatgen.symmetry.analyzer.html
docs/pymatgen.symmetry.bandstructure.html
docs/pymatgen.symmetry.groups.html
docs/pymatgen.symmetry.html
docs/pymatgen.symmetry.kpath.html
docs/pymatgen.symmetry.maggroups.html
docs/pymatgen.symmetry.settings.html
docs/pymatgen.symmetry.site_symmetries.html
docs/pymatgen.symmetry.structure.html
docs/pymatgen.transformations.advanced_transformations.html
docs/pymatgen.transformations.html
docs/pymatgen.transformations.site_transformations.html
docs/pymatgen.transformations.standard_transformations.html
docs/pymatgen.transformations.transformation_abc.html
docs/pymatgen.util.convergence.html
docs/pymatgen.util.coord.html
docs/pymatgen.util.coord_cython.html
docs/pymatgen.util.html
docs/pymatgen.util.io_utils.html
docs/pymatgen.util.num.html
docs/pymatgen.util.plotting.html
docs/pymatgen.util.provenance.html
docs/pymatgen.util.serialization.html
docs/pymatgen.util.string.html
docs/pymatgen.util.testing.html
docs/pymatgen.util.typing.html
docs/pymatgen.vis.html
docs/pymatgen.vis.plotters.html
docs/pymatgen.vis.structure_chemview.html
docs/pymatgen.vis.structure_vtk.html
docs/references.html
docs/search.html
docs/searchindex.js
docs/team.html
docs/usage.html
docs/_images/examples.png
docs/_images/orcid.svg
docs/_images/overview.jpg
docs/_images/pymatgen.png
docs/_modules/abc.html
docs/_modules/index.html
docs/_modules/pathlib.html
docs/_modules/pymatgen.html
docs/_modules/monty/dev.html
docs/_modules/pymatgen/entries.html
docs/_modules/pymatgen/alchemy/filters.html
docs/_modules/pymatgen/alchemy/materials.html
docs/_modules/pymatgen/alchemy/transmuters.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/adsorption.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/aflow_prototypes.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/bond_dissociation.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/bond_valence.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/cost.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/diffusion_analyzer.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/dimensionality.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/energy_models.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/eos.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/ewald.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/excitation.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/fragmenter.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/functional_groups.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/graphs.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/interface.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/interface_reactions.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/local_env.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/molecule_matcher.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/molecule_structure_comparator.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/nmr.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/path_finder.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/phase_diagram.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/piezo.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/piezo_sensitivity.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/pourbaix_diagram.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/prototypes.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/quasiharmonic.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/reaction_calculator.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/structure_analyzer.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/structure_matcher.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/substrate_analyzer.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/surface_analysis.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/thermochemistry.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/transition_state.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/wulff.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/chemenv/connectivity/connected_components.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/chemenv/connectivity/connectivity_finder.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/chemenv/connectivity/environment_nodes.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/chemenv/connectivity/structure_connectivity.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/chemenv_strategies.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometry_finder.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/structure_environments.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/voronoi.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/chemenv/utils/chemenv_config.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/chemenv/utils/chemenv_errors.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/chemenv/utils/coordination_geometry_utils.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/chemenv/utils/defs_utils.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/chemenv/utils/func_utils.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/chemenv/utils/graph_utils.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/chemenv/utils/math_utils.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/chemenv/utils/scripts_utils.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/cost/cost.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/defects/core.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/defects/corrections.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/defects/defect_compatibility.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/defects/dilute_solution_model.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/defects/generators.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/defects/thermodynamics.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/defects/utils.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/diffraction/core.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/diffraction/neutron.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/diffraction/tem.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/diffraction/xrd.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/elasticity/elastic.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/elasticity/strain.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/elasticity/stress.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/ferroelectricity/polarization.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/gb/grain.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/magnetism/analyzer.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/magnetism/heisenberg.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/magnetism/jahnteller.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/structure_prediction/dopant_predictor.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/structure_prediction/substitution_probability.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/structure_prediction/substitutor.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/structure_prediction/volume_predictor.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/topological/spillage.html
docs/_modules/pymatgen/analysis/xas/spectrum.html
docs/_modules/pymatgen/apps/battery/analyzer.html
docs/_modules/pymatgen/apps/battery/battery_abc.html
docs/_modules/pymatgen/apps/battery/conversion_battery.html
docs/_modules/pymatgen/apps/battery/insertion_battery.html
docs/_modules/pymatgen/apps/battery/plotter.html
docs/_modules/pymatgen/apps/borg/hive.html
docs/_modules/pymatgen/apps/borg/queen.html
docs/_modules/pymatgen/cli/feff_input_generation.html
docs/_modules/pymatgen/cli/feff_plot_cross_section.html
docs/_modules/pymatgen/cli/feff_plot_dos.html
docs/_modules/pymatgen/cli/gaussian_analyzer.html
docs/_modules/pymatgen/cli/get_environment.html
docs/_modules/pymatgen/cli/pmg.html
docs/_modules/pymatgen/cli/pmg_analyze.html
docs/_modules/pymatgen/cli/pmg_config.html
docs/_modules/pymatgen/cli/pmg_plot.html
docs/_modules/pymatgen/cli/pmg_potcar.html
docs/_modules/pymatgen/cli/pmg_query.html
docs/_modules/pymatgen/cli/pmg_structure.html
docs/_modules/pymatgen/command_line/aconvasp_caller.html
docs/_modules/pymatgen/command_line/bader_caller.html
docs/_modules/pymatgen/command_line/critic2_caller.html
docs/_modules/pymatgen/command_line/enumlib_caller.html
docs/_modules/pymatgen/command_line/gulp_caller.html
docs/_modules/pymatgen/command_line/mcsqs_caller.html
docs/_modules/pymatgen/command_line/vampire_caller.html
docs/_modules/pymatgen/core/bonds.html
docs/_modules/pymatgen/core/composition.html
docs/_modules/pymatgen/core/ion.html
docs/_modules/pymatgen/core/lattice.html
docs/_modules/pymatgen/core/libxcfunc.html
docs/_modules/pymatgen/core/molecular_orbitals.html
docs/_modules/pymatgen/core/operations.html
docs/_modules/pymatgen/core/periodic_table.html
docs/_modules/pymatgen/core/sites.html
docs/_modules/pymatgen/core/spectrum.html
docs/_modules/pymatgen/core/structure.html
docs/_modules/pymatgen/core/surface.html
docs/_modules/pymatgen/core/tensors.html
docs/_modules/pymatgen/core/trajectory.html
docs/_modules/pymatgen/core/units.html
docs/_modules/pymatgen/core/xcfunc.html
docs/_modules/pymatgen/electronic_structure/bandstructure.html
docs/_modules/pymatgen/electronic_structure/boltztrap.html
docs/_modules/pymatgen/electronic_structure/cohp.html
docs/_modules/pymatgen/electronic_structure/core.html
docs/_modules/pymatgen/electronic_structure/dos.html
docs/_modules/pymatgen/electronic_structure/plotter.html
docs/_modules/pymatgen/entries/compatibility.html
docs/_modules/pymatgen/entries/computed_entries.html
docs/_modules/pymatgen/entries/entry_tools.html
docs/_modules/pymatgen/entries/exp_entries.html
docs/_modules/pymatgen/ext/cod.html
docs/_modules/pymatgen/ext/crystalsai.html
docs/_modules/pymatgen/ext/jhu.html
docs/_modules/pymatgen/ext/matproj.html
docs/_modules/pymatgen/io/adf.html
docs/_modules/pymatgen/io/aiida.html
docs/_modules/pymatgen/io/ase.html
docs/_modules/pymatgen/io/atat.html
docs/_modules/pymatgen/io/babel.html
docs/_modules/pymatgen/io/cif.html
docs/_modules/pymatgen/io/cssr.html
docs/_modules/pymatgen/io/fiesta.html
docs/_modules/pymatgen/io/gaussian.html
docs/_modules/pymatgen/io/lmto.html
docs/_modules/pymatgen/io/lobster.html
docs/_modules/pymatgen/io/nwchem.html
docs/_modules/pymatgen/io/phonopy.html
docs/_modules/pymatgen/io/prismatic.html
docs/_modules/pymatgen/io/pwscf.html
docs/_modules/pymatgen/io/shengbte.html
docs/_modules/pymatgen/io/wannier90.html
docs/_modules/pymatgen/io/xcrysden.html
docs/_modules/pymatgen/io/xr.html
docs/_modules/pymatgen/io/xyz.html
docs/_modules/pymatgen/io/zeopp.html
docs/_modules/pymatgen/io/abinit/abiinspect.html
docs/_modules/pymatgen/io/abinit/abiobjects.html
docs/_modules/pymatgen/io/abinit/abitimer.html
docs/_modules/pymatgen/io/abinit/helpers.html
docs/_modules/pymatgen/io/abinit/inputs.html
docs/_modules/pymatgen/io/abinit/netcdf.html
docs/_modules/pymatgen/io/abinit/pseudos.html
docs/_modules/pymatgen/io/abinit/variable.html
docs/_modules/pymatgen/io/exciting/inputs.html
docs/_modules/pymatgen/io/feff/inputs.html
docs/_modules/pymatgen/io/feff/outputs.html
docs/_modules/pymatgen/io/feff/sets.html
docs/_modules/pymatgen/io/lammps/data.html
docs/_modules/pymatgen/io/lammps/inputs.html
docs/_modules/pymatgen/io/lammps/outputs.html
docs/_modules/pymatgen/io/lammps/utils.html
docs/_modules/pymatgen/io/lobster/inputs.html
docs/_modules/pymatgen/io/lobster/outputs.html
docs/_modules/pymatgen/io/qchem/inputs.html
docs/_modules/pymatgen/io/qchem/outputs.html
docs/_modules/pymatgen/io/qchem/sets.html
docs/_modules/pymatgen/io/qchem/utils.html
docs/_modules/pymatgen/io/vasp/help.html
docs/_modules/pymatgen/io/vasp/inputs.html
docs/_modules/pymatgen/io/vasp/outputs.html
docs/_modules/pymatgen/io/vasp/sets.html
docs/_modules/pymatgen/optimization/linear_assignment_numpy.html
docs/_modules/pymatgen/phonon/bandstructure.html
docs/_modules/pymatgen/phonon/dos.html
docs/_modules/pymatgen/phonon/ir_spectra.html
docs/_modules/pymatgen/phonon/plotter.html
docs/_modules/pymatgen/symmetry/analyzer.html
docs/_modules/pymatgen/symmetry/bandstructure.html
docs/_modules/pymatgen/symmetry/groups.html
docs/_modules/pymatgen/symmetry/kpath.html
docs/_modules/pymatgen/symmetry/maggroups.html
docs/_modules/pymatgen/symmetry/settings.html
docs/_modules/pymatgen/symmetry/site_symmetries.html
docs/_modules/pymatgen/symmetry/structure.html
docs/_modules/pymatgen/transformations/advanced_transformations.html
docs/_modules/pymatgen/transformations/defect_transformations.html
docs/_modules/pymatgen/transformations/site_transformations.html
docs/_modules/pymatgen/transformations/standard_transformations.html
docs/_modules/pymatgen/transformations/transformation_abc.html
docs/_modules/pymatgen/util/convergence.html
docs/_modules/pymatgen/util/coord.html
docs/_modules/pymatgen/util/io_utils.html
docs/_modules/pymatgen/util/num.html
docs/_modules/pymatgen/util/plotting.html
docs/_modules/pymatgen/util/provenance.html
docs/_modules/pymatgen/util/sequence.html
docs/_modules/pymatgen/util/serialization.html
docs/_modules/pymatgen/util/string.html
docs/_modules/pymatgen/util/testing.html
docs/_modules/pymatgen/vis/plotters.html
docs/_modules/pymatgen/vis/structure_chemview.html
docs/_modules/pymatgen/vis/structure_vtk.html
docs/_static/_sphinx_javascript_frameworks_compat.js
docs/_static/basic.css
docs/_static/doctools.js
docs/_static/documentation_options.js
docs/_static/examples.png
docs/_static/favicon.ico
docs/_static/file.png
docs/_static/jquery-3.2.1.js
docs/_static/jquery-3.4.1.js
docs/_static/jquery-3.5.1.js
docs/_static/jquery-3.6.0.js
docs/_static/jquery.js
docs/_static/language_data.js
docs/_static/minus.png
docs/_static/nature.css
docs/_static/orcid.svg
docs/_static/overview.jpg
docs/_static/phase_diagram.png
docs/_static/plus.png
docs/_static/proBlue.css
docs/_static/pygments.css
docs/_static/pymatgen.png
docs/_static/searchtools.js
docs/_static/sphinx_highlight.js
docs/_static/team-map.html
docs/_static/underscore-1.12.0.js
docs/_static/underscore-1.13.1.js
docs/_static/underscore-1.3.1.js
docs/_static/underscore.js
docs/_static/css/badge_only.css
docs/_static/css/custom.css
docs/_static/css/theme.css
docs/_static/css/fonts/Roboto-Slab-Bold.woff
docs/_static/css/fonts/Roboto-Slab-Bold.woff2
docs/_static/css/fonts/Roboto-Slab-Regular.woff
docs/_static/css/fonts/Roboto-Slab-Regular.woff2
docs/_static/css/fonts/fontawesome-webfont.eot
docs/_static/css/fonts/fontawesome-webfont.svg
docs/_static/css/fonts/fontawesome-webfont.ttf
docs/_static/css/fonts/fontawesome-webfont.woff
docs/_static/css/fonts/fontawesome-webfont.woff2
docs/_static/css/fonts/lato-bold-italic.woff
docs/_static/css/fonts/lato-bold-italic.woff2
docs/_static/css/fonts/lato-bold.woff
docs/_static/css/fonts/lato-bold.woff2
docs/_static/css/fonts/lato-normal-italic.woff
docs/_static/css/fonts/lato-normal-italic.woff2
docs/_static/css/fonts/lato-normal.woff
docs/_static/css/fonts/lato-normal.woff2
docs/_static/fonts/FontAwesome.otf
docs/_static/fonts/Inconsolata-Bold.ttf
docs/_static/fonts/Inconsolata-Regular.ttf
docs/_static/fonts/Inconsolata.ttf
docs/_static/fonts/Lato-Bold.ttf
docs/_static/fonts/Lato-Regular.ttf
docs/_static/fonts/Roboto-Slab-Bold.woff
docs/_static/fonts/Roboto-Slab-Bold.woff2
docs/_static/fonts/Roboto-Slab-Light.woff
docs/_static/fonts/Roboto-Slab-Light.woff2
docs/_static/fonts/Roboto-Slab-Regular.woff
docs/_static/fonts/Roboto-Slab-Regular.woff2
docs/_static/fonts/Roboto-Slab-Thin.woff
docs/_static/fonts/Roboto-Slab-Thin.woff2
docs/_static/fonts/RobotoSlab-Bold.ttf
docs/_static/fonts/RobotoSlab-Regular.ttf
docs/_static/fonts/fontawesome-webfont.eot
docs/_static/fonts/fontawesome-webfont.svg
docs/_static/fonts/fontawesome-webfont.ttf
docs/_static/fonts/fontawesome-webfont.woff
docs/_static/fonts/fontawesome-webfont.woff2
docs/_static/fonts/lato-bold-italic.woff
docs/_static/fonts/lato-bold-italic.woff2
docs/_static/fonts/lato-bold.woff
docs/_static/fonts/lato-bold.woff2
docs/_static/fonts/lato-normal-italic.woff
docs/_static/fonts/lato-normal-italic.woff2
docs/_static/fonts/lato-normal.woff
docs/_static/fonts/lato-normal.woff2
docs/_static/fonts/Lato/lato-bold.eot
docs/_static/fonts/Lato/lato-bold.ttf
docs/_static/fonts/Lato/lato-bold.woff
docs/_static/fonts/Lato/lato-bold.woff2
docs/_static/fonts/Lato/lato-bolditalic.eot
docs/_static/fonts/Lato/lato-bolditalic.ttf
docs/_static/fonts/Lato/lato-bolditalic.woff
docs/_static/fonts/Lato/lato-bolditalic.woff2
docs/_static/fonts/Lato/lato-italic.eot
docs/_static/fonts/Lato/lato-italic.ttf
docs/_static/fonts/Lato/lato-italic.woff
docs/_static/fonts/Lato/lato-italic.woff2
docs/_static/fonts/Lato/lato-regular.eot
docs/_static/fonts/Lato/lato-regular.ttf
docs/_static/fonts/Lato/lato-regular.woff
docs/_static/fonts/Lato/lato-regular.woff2
docs/_static/fonts/RobotoSlab/roboto-slab-v7-bold.eot
docs/_static/fonts/RobotoSlab/roboto-slab-v7-bold.ttf
docs/_static/fonts/RobotoSlab/roboto-slab-v7-bold.woff
docs/_static/fonts/RobotoSlab/roboto-slab-v7-bold.woff2
docs/_static/fonts/RobotoSlab/roboto-slab-v7-regular.eot
docs/_static/fonts/RobotoSlab/roboto-slab-v7-regular.ttf
docs/_static/fonts/RobotoSlab/roboto-slab-v7-regular.woff
docs/_static/fonts/RobotoSlab/roboto-slab-v7-regular.woff2
docs/_static/js/badge_only.js
docs/_static/js/html5shiv-printshiv.min.js
docs/_static/js/html5shiv.min.js
docs/_static/js/modernizr.min.js
docs/_static/js/theme.js
docs_rst/Makefile
docs_rst/addons.rst
docs_rst/change_log.rst
docs_rst/compatibility.rst
docs_rst/conf-docset.py
docs_rst/conf-normal.py
docs_rst/conf.py
docs_rst/contributing.rst
docs_rst/index.rst
docs_rst/installation.rst
docs_rst/introduction.rst
docs_rst/latest_changes.rst
docs_rst/make.bat
docs_rst/modules.rst
docs_rst/pymatgen.alchemy.filters.rst
docs_rst/pymatgen.alchemy.materials.rst
docs_rst/pymatgen.alchemy.rst
docs_rst/pymatgen.alchemy.transmuters.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.adsorption.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.bond_dissociation.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.bond_valence.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.chemenv.connectivity.connected_components.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.chemenv.connectivity.connectivity_finder.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.chemenv.connectivity.environment_nodes.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.chemenv.connectivity.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.chemenv.connectivity.structure_connectivity.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.chemenv.coordination_environments.chemenv_strategies.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.chemenv.coordination_environments.coordination_geometries.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.chemenv.coordination_environments.coordination_geometries_files.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.chemenv.coordination_environments.coordination_geometry_finder.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.chemenv.coordination_environments.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.chemenv.coordination_environments.structure_environments.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.chemenv.coordination_environments.voronoi.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.chemenv.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.chemenv.utils.chemenv_config.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.chemenv.utils.chemenv_errors.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.chemenv.utils.coordination_geometry_utils.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.chemenv.utils.defs_utils.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.chemenv.utils.func_utils.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.chemenv.utils.graph_utils.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.chemenv.utils.math_utils.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.chemenv.utils.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.chemenv.utils.scripts_utils.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.chempot_diagram.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.cost.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.diffraction.core.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.diffraction.neutron.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.diffraction.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.diffraction.tem.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.diffraction.xrd.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.dimensionality.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.disorder.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.elasticity.elastic.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.elasticity.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.elasticity.strain.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.elasticity.stress.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.energy_models.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.eos.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.ewald.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.excitation.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.ferroelectricity.polarization.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.ferroelectricity.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.fragmenter.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.functional_groups.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.gb.grain.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.gb.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.graphs.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.hhi.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.interface.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.interface_reactions.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.interfaces.coherent_interfaces.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.interfaces.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.interfaces.substrate_analyzer.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.interfaces.zsl.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.local_env.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.magnetism.analyzer.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.magnetism.heisenberg.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.magnetism.jahnteller.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.magnetism.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.molecule_matcher.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.molecule_structure_comparator.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.nmr.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.path_finder.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.phase_diagram.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.piezo.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.piezo_sensitivity.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.pourbaix_diagram.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.prototypes.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.quasiharmonic.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.reaction_calculator.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.solar.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.solar.slme.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.structure_analyzer.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.structure_matcher.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.structure_prediction.dopant_predictor.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.structure_prediction.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.structure_prediction.substitution_probability.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.structure_prediction.substitutor.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.structure_prediction.volume_predictor.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.substrate_analyzer.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.surface_analysis.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.thermochemistry.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.topological.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.topological.spillage.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.transition_state.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.wulff.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.xas.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.xas.spectrum.rst
docs_rst/pymatgen.analysis.xps.rst
docs_rst/pymatgen.apps.battery.analyzer.rst
docs_rst/pymatgen.apps.battery.battery_abc.rst
docs_rst/pymatgen.apps.battery.conversion_battery.rst
docs_rst/pymatgen.apps.battery.insertion_battery.rst
docs_rst/pymatgen.apps.battery.plotter.rst
docs_rst/pymatgen.apps.battery.rst
docs_rst/pymatgen.apps.borg.hive.rst
docs_rst/pymatgen.apps.borg.queen.rst
docs_rst/pymatgen.apps.borg.rst
docs_rst/pymatgen.apps.rst
docs_rst/pymatgen.cli.feff_plot_cross_section.rst
docs_rst/pymatgen.cli.feff_plot_dos.rst
docs_rst/pymatgen.cli.gaussian_analyzer.rst
docs_rst/pymatgen.cli.get_environment.rst
docs_rst/pymatgen.cli.pmg.rst
docs_rst/pymatgen.cli.pmg_analyze.rst
docs_rst/pymatgen.cli.pmg_config.rst
docs_rst/pymatgen.cli.pmg_plot.rst
docs_rst/pymatgen.cli.pmg_potcar.rst
docs_rst/pymatgen.cli.pmg_query.rst
docs_rst/pymatgen.cli.pmg_structure.rst
docs_rst/pymatgen.cli.rst
docs_rst/pymatgen.command_line.bader_caller.rst
docs_rst/pymatgen.command_line.chargemol_caller.rst
docs_rst/pymatgen.command_line.critic2_caller.rst
docs_rst/pymatgen.command_line.enumlib_caller.rst
docs_rst/pymatgen.command_line.gulp_caller.rst
docs_rst/pymatgen.command_line.mcsqs_caller.rst
docs_rst/pymatgen.command_line.rst
docs_rst/pymatgen.command_line.vampire_caller.rst
docs_rst/pymatgen.core.bonds.rst
docs_rst/pymatgen.core.composition.rst
docs_rst/pymatgen.core.interface.rst
docs_rst/pymatgen.core.ion.rst
docs_rst/pymatgen.core.lattice.rst
docs_rst/pymatgen.core.libxcfunc.rst
docs_rst/pymatgen.core.molecular_orbitals.rst
docs_rst/pymatgen.core.operations.rst
docs_rst/pymatgen.core.periodic_table.rst
docs_rst/pymatgen.core.rst
docs_rst/pymatgen.core.sites.rst
docs_rst/pymatgen.core.spectrum.rst
docs_rst/pymatgen.core.structure.rst
docs_rst/pymatgen.core.surface.rst
docs_rst/pymatgen.core.tensors.rst
docs_rst/pymatgen.core.trajectory.rst
docs_rst/pymatgen.core.units.rst
docs_rst/pymatgen.core.xcfunc.rst
docs_rst/pymatgen.dao.rst
docs_rst/pymatgen.electronic_structure.bandstructure.rst
docs_rst/pymatgen.electronic_structure.boltztrap.rst
docs_rst/pymatgen.electronic_structure.boltztrap2.rst
docs_rst/pymatgen.electronic_structure.cohp.rst
docs_rst/pymatgen.electronic_structure.core.rst
docs_rst/pymatgen.electronic_structure.dos.rst
docs_rst/pymatgen.electronic_structure.plotter.rst
docs_rst/pymatgen.electronic_structure.rst
docs_rst/pymatgen.entries.compatibility.rst
docs_rst/pymatgen.entries.computed_entries.rst
docs_rst/pymatgen.entries.correction_calculator.rst
docs_rst/pymatgen.entries.entry_tools.rst
docs_rst/pymatgen.entries.exp_entries.rst
docs_rst/pymatgen.entries.mixing_scheme.rst
docs_rst/pymatgen.entries.rst
docs_rst/pymatgen.ext.cod.rst
docs_rst/pymatgen.ext.matproj.rst
docs_rst/pymatgen.ext.optimade.rst
docs_rst/pymatgen.ext.rst
docs_rst/pymatgen.io.abinit.abiobjects.rst
docs_rst/pymatgen.io.abinit.abitimer.rst
docs_rst/pymatgen.io.abinit.inputs.rst
docs_rst/pymatgen.io.abinit.netcdf.rst
docs_rst/pymatgen.io.abinit.pseudos.rst
docs_rst/pymatgen.io.abinit.rst
docs_rst/pymatgen.io.abinit.variable.rst
docs_rst/pymatgen.io.adf.rst
docs_rst/pymatgen.io.ase.rst
docs_rst/pymatgen.io.atat.rst
docs_rst/pymatgen.io.babel.rst
docs_rst/pymatgen.io.cif.rst
docs_rst/pymatgen.io.core.rst
docs_rst/pymatgen.io.cp2k.inputs.rst
docs_rst/pymatgen.io.cp2k.outputs.rst
docs_rst/pymatgen.io.cp2k.rst
docs_rst/pymatgen.io.cp2k.sets.rst
docs_rst/pymatgen.io.cp2k.utils.rst
docs_rst/pymatgen.io.cssr.rst
docs_rst/pymatgen.io.cube.rst
docs_rst/pymatgen.io.exciting.inputs.rst
docs_rst/pymatgen.io.exciting.rst
docs_rst/pymatgen.io.feff.inputs.rst
docs_rst/pymatgen.io.feff.outputs.rst
docs_rst/pymatgen.io.feff.rst
docs_rst/pymatgen.io.feff.sets.rst
docs_rst/pymatgen.io.fiesta.rst
docs_rst/pymatgen.io.gaussian.rst
docs_rst/pymatgen.io.jarvis.rst
docs_rst/pymatgen.io.lammps.data.rst
docs_rst/pymatgen.io.lammps.inputs.rst
docs_rst/pymatgen.io.lammps.outputs.rst
docs_rst/pymatgen.io.lammps.rst
docs_rst/pymatgen.io.lammps.utils.rst
docs_rst/pymatgen.io.lmto.rst
docs_rst/pymatgen.io.lobster.inputs.rst
docs_rst/pymatgen.io.lobster.lobsterenv.rst
docs_rst/pymatgen.io.lobster.outputs.rst
docs_rst/pymatgen.io.lobster.rst
docs_rst/pymatgen.io.nwchem.rst
docs_rst/pymatgen.io.packmol.rst
docs_rst/pymatgen.io.phonopy.rst
docs_rst/pymatgen.io.prismatic.rst
docs_rst/pymatgen.io.pwscf.rst
docs_rst/pymatgen.io.qchem.inputs.rst
docs_rst/pymatgen.io.qchem.outputs.rst
docs_rst/pymatgen.io.qchem.rst
docs_rst/pymatgen.io.qchem.sets.rst
docs_rst/pymatgen.io.qchem.utils.rst
docs_rst/pymatgen.io.res.rst
docs_rst/pymatgen.io.rst
docs_rst/pymatgen.io.shengbte.rst
docs_rst/pymatgen.io.template.rst
docs_rst/pymatgen.io.vasp.help.rst
docs_rst/pymatgen.io.vasp.inputs.rst
docs_rst/pymatgen.io.vasp.optics.rst
docs_rst/pymatgen.io.vasp.outputs.rst
docs_rst/pymatgen.io.vasp.rst
docs_rst/pymatgen.io.vasp.sets.rst
docs_rst/pymatgen.io.wannier90.rst
docs_rst/pymatgen.io.xcrysden.rst
docs_rst/pymatgen.io.xr.rst
docs_rst/pymatgen.io.xtb.inputs.rst
docs_rst/pymatgen.io.xtb.outputs.rst
docs_rst/pymatgen.io.xtb.rst
docs_rst/pymatgen.io.xyz.rst
docs_rst/pymatgen.io.zeopp.rst
docs_rst/pymatgen.optimization.linear_assignment.rst
docs_rst/pymatgen.optimization.linear_assignment_numpy.rst
docs_rst/pymatgen.optimization.neighbors.rst
docs_rst/pymatgen.optimization.rst
docs_rst/pymatgen.phonon.bandstructure.rst
docs_rst/pymatgen.phonon.dos.rst
docs_rst/pymatgen.phonon.gruneisen.rst
docs_rst/pymatgen.phonon.ir_spectra.rst
docs_rst/pymatgen.phonon.plotter.rst
docs_rst/pymatgen.phonon.rst
docs_rst/pymatgen.phonon.thermal_displacements.rst
docs_rst/pymatgen.rst
docs_rst/pymatgen.symmetry.analyzer.rst
docs_rst/pymatgen.symmetry.bandstructure.rst
docs_rst/pymatgen.symmetry.groups.rst
docs_rst/pymatgen.symmetry.kpath.rst
docs_rst/pymatgen.symmetry.maggroups.rst
docs_rst/pymatgen.symmetry.rst
docs_rst/pymatgen.symmetry.settings.rst
docs_rst/pymatgen.symmetry.site_symmetries.rst
docs_rst/pymatgen.symmetry.structure.rst
docs_rst/pymatgen.transformations.advanced_transformations.rst
docs_rst/pymatgen.transformations.rst
docs_rst/pymatgen.transformations.site_transformations.rst
docs_rst/pymatgen.transformations.standard_transformations.rst
docs_rst/pymatgen.transformations.transformation_abc.rst
docs_rst/pymatgen.util.convergence.rst
docs_rst/pymatgen.util.coord.rst
docs_rst/pymatgen.util.coord_cython.rst
docs_rst/pymatgen.util.io_utils.rst
docs_rst/pymatgen.util.num.rst
docs_rst/pymatgen.util.plotting.rst
docs_rst/pymatgen.util.provenance.rst
docs_rst/pymatgen.util.rst
docs_rst/pymatgen.util.string.rst
docs_rst/pymatgen.util.testing.rst
docs_rst/pymatgen.util.typing.rst
docs_rst/pymatgen.vis.plotters.rst
docs_rst/pymatgen.vis.rst
docs_rst/pymatgen.vis.structure_chemview.rst
docs_rst/pymatgen.vis.structure_vtk.rst
docs_rst/references.rst
docs_rst/team.rst
docs_rst/usage.rst
docs_rst/_static/examples.png
docs_rst/_static/favicon.ico
docs_rst/_static/orcid.svg
docs_rst/_static/overview.jpg
docs_rst/_static/phase_diagram.png
docs_rst/_static/pymatgen.png
docs_rst/_static/team-map.html
docs_rst/_static/css/custom.css
docs_rst/_templates/layout.html
docs_rst/proBlue/LICENSE.txt
docs_rst/proBlue/README.txt
docs_rst/proBlue/theme.conf
docs_rst/proBlue/static/proBlue.css
pymatgen/dao.py
pymatgen.egg-info/PKG-INFO
pymatgen.egg-info/SOURCES.txt
pymatgen.egg-info/dependency_links.txt
pymatgen.egg-info/entry_points.txt
pymatgen.egg-info/requires.txt
pymatgen.egg-info/top_level.txt
pymatgen/alchemy/__init__.py
pymatgen/alchemy/filters.py
pymatgen/alchemy/materials.py
pymatgen/alchemy/transmuters.py
pymatgen/analysis/adsorption.py
pymatgen/analysis/aflow_prototypes.json
pymatgen/analysis/atomic_subshell_photoionization_cross_sections.csv
pymatgen/analysis/bond_dissociation.py
pymatgen/analysis/bond_valence.py
pymatgen/analysis/bonds_jmol_ob.yaml
pymatgen/analysis/bvparam_1991.yaml
pymatgen/analysis/chempot_diagram.py
pymatgen/analysis/cn_opt_params.yaml
pymatgen/analysis/cost.py
pymatgen/analysis/costdb_elements.csv
pymatgen/analysis/dimensionality.py
pymatgen/analysis/disorder.py
pymatgen/analysis/energy_models.py
pymatgen/analysis/eos.py
pymatgen/analysis/ewald.py
pymatgen/analysis/excitation.py
pymatgen/analysis/fragmenter.py
pymatgen/analysis/functional_groups.py
pymatgen/analysis/graphs.py
pymatgen/analysis/hhi.py
pymatgen/analysis/hhi_data.csv
pymatgen/analysis/icsd_bv.yaml
pymatgen/analysis/interface.py
pymatgen/analysis/interface_reactions.py
pymatgen/analysis/ionic_radii.json
pymatgen/analysis/local_env.py
pymatgen/analysis/molecule_matcher.py
pymatgen/analysis/molecule_structure_comparator.py
pymatgen/analysis/nmr.py
pymatgen/analysis/op_params.yaml
pymatgen/analysis/path_finder.py
pymatgen/analysis/phase_diagram.py
pymatgen/analysis/piezo.py
pymatgen/analysis/piezo_sensitivity.py
pymatgen/analysis/pourbaix_diagram.py
pymatgen/analysis/prototypes.py
pymatgen/analysis/quasiharmonic.py
pymatgen/analysis/reaction_calculator.py
pymatgen/analysis/structure_analyzer.py
pymatgen/analysis/structure_matcher.py
pymatgen/analysis/substrate_analyzer.py
pymatgen/analysis/surface_analysis.py
pymatgen/analysis/thermochemistry.py
pymatgen/analysis/transition_state.py
pymatgen/analysis/vesta_cutoffs.yaml
pymatgen/analysis/wulff.py
pymatgen/analysis/xps.py
pymatgen/analysis/chemenv/__init__.py
pymatgen/analysis/chemenv/connectivity/__init__.py
pymatgen/analysis/chemenv/connectivity/connected_components.py
pymatgen/analysis/chemenv/connectivity/connectivity_finder.py
pymatgen/analysis/chemenv/connectivity/environment_nodes.py
pymatgen/analysis/chemenv/connectivity/structure_connectivity.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/__init__.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/chemenv_strategies.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometry_finder.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/structure_environments.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/voronoi.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/A#2.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/AC#12.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/BO_1#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/BO_2#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/BO_3#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/BS_1#10.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/BS_2#10.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/C#12.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/C#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/CO#11.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/DD#20.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/DD#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/DDPN#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/DI#11.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/ET#7.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/FO#7.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/H#10.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/H#11.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/HA#12.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/HB#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/HD#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/HP#12.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/I#12.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/L#2.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/MI#10.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/O#6.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/O#6_explicit.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/PA#10.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/PB#7.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/PBP#12.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/PCPA#11.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/PP#10.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/PP#5.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/PP#6.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/S#1.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/S#10.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/S#12.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/S#4.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/S#5.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SA#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SBSA#10.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SBT#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SC#12.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SH#11.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SH#13.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SMA#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SS#4.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SS#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/ST#7.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SY#4.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/T#4.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/T#5.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/T#6.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TBSA#10.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TBT#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TC#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TI#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TL#3.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TO_1#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TO_2#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TO_3#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TS#3.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TT#12.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TT_1#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TT_2#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TT_3#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TY#3.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/__init__.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/allcg.txt
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/strategy_files/ImprovedConfidenceCutoffDefaultParameters.json
pymatgen/analysis/chemenv/utils/__init__.py
pymatgen/analysis/chemenv/utils/chemenv_config.py
pymatgen/analysis/chemenv/utils/chemenv_errors.py
pymatgen/analysis/chemenv/utils/coordination_geometry_utils.py
pymatgen/analysis/chemenv/utils/defs_utils.py
pymatgen/analysis/chemenv/utils/func_utils.py
pymatgen/analysis/chemenv/utils/graph_utils.py
pymatgen/analysis/chemenv/utils/math_utils.py
pymatgen/analysis/chemenv/utils/scripts_utils.py
pymatgen/analysis/diffraction/__init__.py
pymatgen/analysis/diffraction/atomic_scattering_params.json
pymatgen/analysis/diffraction/core.py
pymatgen/analysis/diffraction/neutron.py
pymatgen/analysis/diffraction/neutron_scattering_length.json
pymatgen/analysis/diffraction/tem.py
pymatgen/analysis/diffraction/xrd.py
pymatgen/analysis/elasticity/__init__.py
pymatgen/analysis/elasticity/elastic.py
pymatgen/analysis/elasticity/strain.py
pymatgen/analysis/elasticity/stress.py
pymatgen/analysis/ferroelectricity/__init__.py
pymatgen/analysis/ferroelectricity/polarization.py
pymatgen/analysis/gb/__init__.py
pymatgen/analysis/gb/grain.py
pymatgen/analysis/interfaces/__init__.py
pymatgen/analysis/interfaces/coherent_interfaces.py
pymatgen/analysis/interfaces/substrate_analyzer.py
pymatgen/analysis/interfaces/zsl.py
pymatgen/analysis/magnetism/__init__.py
pymatgen/analysis/magnetism/analyzer.py
pymatgen/analysis/magnetism/default_magmoms.yaml
pymatgen/analysis/magnetism/heisenberg.py
pymatgen/analysis/magnetism/jahnteller.py
pymatgen/analysis/solar/__init__.py
pymatgen/analysis/solar/am1.5G.dat
pymatgen/analysis/solar/slme.py
pymatgen/analysis/structure_prediction/DLS_bond_params.yaml
pymatgen/analysis/structure_prediction/__init__.py
pymatgen/analysis/structure_prediction/dopant_predictor.py
pymatgen/analysis/structure_prediction/substitution_probability.py
pymatgen/analysis/structure_prediction/substitutor.py
pymatgen/analysis/structure_prediction/volume_predictor.py
pymatgen/analysis/structure_prediction/data/lambda.json
pymatgen/analysis/structure_prediction/data/pair_correlation.json
pymatgen/analysis/topological/__init__.py
pymatgen/analysis/topological/spillage.py
pymatgen/analysis/topological/tests/WAVECAR-NonSOC
pymatgen/analysis/topological/tests/WAVECAR-SOC
pymatgen/analysis/xas/__init__.py
pymatgen/analysis/xas/spectrum.py
pymatgen/apps/__init__.py
pymatgen/apps/battery/__init__.py
pymatgen/apps/battery/analyzer.py
pymatgen/apps/battery/battery_abc.py
pymatgen/apps/battery/conversion_battery.py
pymatgen/apps/battery/insertion_battery.py
pymatgen/apps/battery/plotter.py
pymatgen/apps/borg/__init__.py
pymatgen/apps/borg/hive.py
pymatgen/apps/borg/queen.py
pymatgen/cli/__init__.py
pymatgen/cli/feff_plot_cross_section.py
pymatgen/cli/feff_plot_dos.py
pymatgen/cli/gaussian_analyzer.py
pymatgen/cli/get_environment.py
pymatgen/cli/pmg.py
pymatgen/cli/pmg_analyze.py
pymatgen/cli/pmg_config.py
pymatgen/cli/pmg_plot.py
pymatgen/cli/pmg_potcar.py
pymatgen/cli/pmg_query.py
pymatgen/cli/pmg_structure.py
pymatgen/command_line/OxideTersoffPotentials
pymatgen/command_line/__init__.py
pymatgen/command_line/bader_caller.py
pymatgen/command_line/bush.lib
pymatgen/command_line/chargemol_caller.py
pymatgen/command_line/critic2_caller.py
pymatgen/command_line/enumlib_caller.py
pymatgen/command_line/gulp_caller.py
pymatgen/command_line/lewis.lib
pymatgen/command_line/mcsqs_caller.py
pymatgen/command_line/vampire_caller.py
pymatgen/core/__init__.py
pymatgen/core/bond_lengths.json
pymatgen/core/bonds.py
pymatgen/core/composition.py
pymatgen/core/func_groups.json
pymatgen/core/interface.py
pymatgen/core/ion.py
pymatgen/core/lattice.py
pymatgen/core/libxc_docs.json
pymatgen/core/libxcfunc.py
pymatgen/core/molecular_orbitals.py
pymatgen/core/operations.py
pymatgen/core/periodic_table.json
pymatgen/core/periodic_table.py
pymatgen/core/py.typed
pymatgen/core/quad_data.json
pymatgen/core/reconstructions_archive.json
pymatgen/core/sites.py
pymatgen/core/spectrum.py
pymatgen/core/structure.py
pymatgen/core/surface.py
pymatgen/core/tensors.py
pymatgen/core/trajectory.py
pymatgen/core/units.py
pymatgen/core/xcfunc.py
pymatgen/electronic_structure/__init__.py
pymatgen/electronic_structure/bandstructure.py
pymatgen/electronic_structure/boltztrap.py
pymatgen/electronic_structure/boltztrap2.py
pymatgen/electronic_structure/cohp.py
pymatgen/electronic_structure/core.py
pymatgen/electronic_structure/dos.py
pymatgen/electronic_structure/plotter.py
pymatgen/entries/MITCompatibility.yaml
pymatgen/entries/MP2020Compatibility.yaml
pymatgen/entries/MPCompatibility.yaml
pymatgen/entries/__init__.py
pymatgen/entries/calc_compounds.json.gz
pymatgen/entries/compatibility.py
pymatgen/entries/computed_entries.py
pymatgen/entries/correction_calculator.py
pymatgen/entries/entry_tools.py
pymatgen/entries/exp_compounds.json.gz
pymatgen/entries/exp_entries.py
pymatgen/entries/mixing_scheme.py
pymatgen/entries/data/g_els.json
pymatgen/entries/data/nist_gas_gf.json
pymatgen/ext/cod.py
pymatgen/ext/matproj.py
pymatgen/ext/optimade.py
pymatgen/io/adf.py
pymatgen/io/ase.py
pymatgen/io/atat.py
pymatgen/io/babel.py
pymatgen/io/cif.py
pymatgen/io/core.py
pymatgen/io/cssr.py
pymatgen/io/cube.py
pymatgen/io/fiesta.py
pymatgen/io/gaussian.py
pymatgen/io/jarvis.py
pymatgen/io/lmto.py
pymatgen/io/nwchem.py
pymatgen/io/packmol.py
pymatgen/io/phonopy.py
pymatgen/io/prismatic.py
pymatgen/io/pwscf.py
pymatgen/io/res.py
pymatgen/io/shengbte.py
pymatgen/io/template.py
pymatgen/io/wannier90.py
pymatgen/io/xcrysden.py
pymatgen/io/xr.py
pymatgen/io/xyz.py
pymatgen/io/zeopp.py
pymatgen/io/abinit/__init__.py
pymatgen/io/abinit/abiobjects.py
pymatgen/io/abinit/abitimer.py
pymatgen/io/abinit/inputs.py
pymatgen/io/abinit/netcdf.py
pymatgen/io/abinit/pseudos.py
pymatgen/io/abinit/variable.py
pymatgen/io/cp2k/__init__.py
pymatgen/io/cp2k/inputs.py
pymatgen/io/cp2k/outputs.py
pymatgen/io/cp2k/sets.py
pymatgen/io/cp2k/settings.yaml
pymatgen/io/cp2k/utils.py
pymatgen/io/exciting/__init__.py
pymatgen/io/exciting/inputs.py
pymatgen/io/feff/MPELNESSet.yaml
pymatgen/io/feff/MPEXAFSSet.yaml
pymatgen/io/feff/MPEXELFSSet.yaml
pymatgen/io/feff/MPXANESSet.yaml
pymatgen/io/feff/__init__.py
pymatgen/io/feff/inputs.py
pymatgen/io/feff/outputs.py
pymatgen/io/feff/sets.py
pymatgen/io/lammps/CoeffsDataType.yaml
pymatgen/io/lammps/__init__.py
pymatgen/io/lammps/data.py
pymatgen/io/lammps/inputs.py
pymatgen/io/lammps/outputs.py
pymatgen/io/lammps/utils.py
pymatgen/io/lammps/templates/md.txt
pymatgen/io/lobster/__init__.py
pymatgen/io/lobster/inputs.py
pymatgen/io/lobster/lobsterenv.py
pymatgen/io/lobster/outputs.py
pymatgen/io/lobster/lobster_basis/BASIS_PBE_54_max.yaml
pymatgen/io/lobster/lobster_basis/BASIS_PBE_54_min.yaml
pymatgen/io/lobster/lobster_basis/BASIS_PBE_54_standard.yaml
pymatgen/io/qchem/__init__.py
pymatgen/io/qchem/inputs.py
pymatgen/io/qchem/outputs.py
pymatgen/io/qchem/sets.py
pymatgen/io/qchem/utils.py
pymatgen/io/vasp/MITRelaxSet.yaml
pymatgen/io/vasp/MPAbsorptionSet.yaml
pymatgen/io/vasp/MPHSERelaxSet.yaml
pymatgen/io/vasp/MPRelaxSet.yaml
pymatgen/io/vasp/MPSCANRelaxSet.yaml
pymatgen/io/vasp/MVLGWSet.yaml
pymatgen/io/vasp/MVLRelax52Set.yaml
pymatgen/io/vasp/VASPIncarBase.yaml
pymatgen/io/vasp/__init__.py
pymatgen/io/vasp/help.py
pymatgen/io/vasp/incar_parameters.json
pymatgen/io/vasp/inputs.py
pymatgen/io/vasp/optics.py
pymatgen/io/vasp/outputs.py
pymatgen/io/vasp/sets.py
pymatgen/io/vasp/vasp_potcar_file_hashes.json
pymatgen/io/vasp/vasp_potcar_pymatgen_hashes.json
pymatgen/io/vasp/vdW_parameters.yaml
pymatgen/io/xtb/__init__.py
pymatgen/io/xtb/inputs.py
pymatgen/io/xtb/outputs.py
pymatgen/optimization/__init__.py
pymatgen/optimization/linear_assignment.pyx
pymatgen/optimization/linear_assignment_numpy.py
pymatgen/optimization/neighbors.pyx
pymatgen/phonon/__init__.py
pymatgen/phonon/bandstructure.py
pymatgen/phonon/dos.py
pymatgen/phonon/gruneisen.py
pymatgen/phonon/ir_spectra.py
pymatgen/phonon/plotter.py
pymatgen/phonon/thermal_displacements.py
pymatgen/symmetry/__init__.py
pymatgen/symmetry/analyzer.py
pymatgen/symmetry/bandstructure.py
pymatgen/symmetry/groups.py
pymatgen/symmetry/kpath.py
pymatgen/symmetry/maggroups.py
pymatgen/symmetry/settings.py
pymatgen/symmetry/site_symmetries.py
pymatgen/symmetry/structure.py
pymatgen/symmetry/symm_data.json
pymatgen/symmetry/symm_data.yaml
pymatgen/symmetry/symm_data_magnetic.sqlite
pymatgen/symmetry/symm_ops.json
pymatgen/symmetry/symm_ops.yaml
pymatgen/transformations/__init__.py
pymatgen/transformations/advanced_transformations.py
pymatgen/transformations/site_transformations.py
pymatgen/transformations/standard_transformations.py
pymatgen/transformations/transformation_abc.py
pymatgen/util/__init__.py
pymatgen/util/convergence.py
pymatgen/util/coord.py
pymatgen/util/coord_cython.pyx
pymatgen/util/io_utils.py
pymatgen/util/num.py
pymatgen/util/plotly_chempot_layouts.json
pymatgen/util/plotly_interface_rxn_layouts.json
pymatgen/util/plotly_pd_layouts.json
pymatgen/util/plotting.py
pymatgen/util/provenance.py
pymatgen/util/string.py
pymatgen/util/testing.py
pymatgen/util/typing.py
pymatgen/util/structures/BaNiO3.json
pymatgen/util/structures/CsCl.json
pymatgen/util/structures/Graphite.json
pymatgen/util/structures/He_BCC.json
pymatgen/util/structures/K2O2.json
pymatgen/util/structures/La2CoO4F.json
pymatgen/util/structures/Li10GeP2S12.json
pymatgen/util/structures/Li2O.json
pymatgen/util/structures/Li2O2.json
pymatgen/util/structures/Li3V2(PO4)3.json
pymatgen/util/structures/LiFePO4.json
pymatgen/util/structures/NaFePO4.json
pymatgen/util/structures/Pb2TiZrO6.json
pymatgen/util/structures/Si.json
pymatgen/util/structures/SiO2.json
pymatgen/util/structures/Si_SiO2_Interface.json
pymatgen/util/structures/Sn.json
pymatgen/util/structures/SrTiO3.json
pymatgen/util/structures/TiO2.json
pymatgen/util/structures/TlBiSe2.json
pymatgen/util/structures/VO2.json
pymatgen/vis/ElementColorSchemes.yaml
pymatgen/vis/__init__.py
pymatgen/vis/plotters.py
pymatgen/vis/structure_chemview.py
pymatgen/vis/structure_vtk.py

@janosh
Copy link
Member Author

janosh commented Nov 18, 2022

new SOURCES.txt (482 lines)
LICENSE
README.md
pyproject.toml
setup.cfg
setup.py
cmd_line/bader/Linux_64bit/bader
cmd_line/boltztrap/Darwin_64bit/BoltzTraP
cmd_line/boltztrap/Darwin_64bit/x_trans
cmd_line/boltztrap/Linux_64bit/x_trans
cmd_line/enum/README
cmd_line/enum/Linux_64bit/enum.x
cmd_line/enum/Linux_64bit/makestr.x
cmd_line/gulp/Libraries/belashchenko.lib
cmd_line/gulp/Libraries/bks.lib
cmd_line/gulp/Libraries/bresme_water.lib
cmd_line/gulp/Libraries/bush.lib
cmd_line/gulp/Libraries/carbonate.lib
cmd_line/gulp/Libraries/catlow.lib
cmd_line/gulp/Libraries/clayFF.lib
cmd_line/gulp/Libraries/clerirosato.lib
cmd_line/gulp/Libraries/dreiding.lib
cmd_line/gulp/Libraries/dreiding_paper.lib
cmd_line/gulp/Libraries/edip_marks.lib
cmd_line/gulp/Libraries/eledata
cmd_line/gulp/Libraries/ffsioh.lib
cmd_line/gulp/Libraries/finnissinclair.lib
cmd_line/gulp/Libraries/garofalini.lib
cmd_line/gulp/Libraries/glue.lib
cmd_line/gulp/Libraries/johnson.lib
cmd_line/gulp/Libraries/kornyshev.lib
cmd_line/gulp/Libraries/lewis.lib
cmd_line/gulp/Libraries/meam_1nn.lib
cmd_line/gulp/Libraries/meidavenport.lib
cmd_line/gulp/Libraries/mox.lib
cmd_line/gulp/Libraries/old-clayFF.lib
cmd_line/gulp/Libraries/reaxff.lib
cmd_line/gulp/Libraries/reaxff_auoh.lib
cmd_line/gulp/Libraries/reaxff_ausch.lib
cmd_line/gulp/Libraries/reaxff_bazro3.lib
cmd_line/gulp/Libraries/reaxff_feoh.lib
cmd_line/gulp/Libraries/reaxff_general.lib
cmd_line/gulp/Libraries/reaxff_oxidative.lib
cmd_line/gulp/Libraries/reaxff_sicho.lib
cmd_line/gulp/Libraries/reaxff_sio2.lib
cmd_line/gulp/Libraries/reaxff_siohna.lib
cmd_line/gulp/Libraries/reaxff_zno.lib
cmd_line/gulp/Libraries/streitzmintmire.lib
cmd_line/gulp/Libraries/suttonchen.lib
cmd_line/gulp/Libraries/tersoff.lib
cmd_line/gulp/Libraries/uff.lib
cmd_line/gulp/Libraries/vashishta.lib
cmd_line/gulp/Libraries/vbo.lib
cmd_line/gulp/Linux_64bit/gulp
cmd_line/packmol/Linux_64bit/packmol
pymatgen.egg-info/PKG-INFO
pymatgen.egg-info/SOURCES.txt
pymatgen.egg-info/dependency_links.txt
pymatgen.egg-info/entry_points.txt
pymatgen.egg-info/requires.txt
pymatgen.egg-info/top_level.txt
pymatgen/alchemy/__init__.py
pymatgen/alchemy/filters.py
pymatgen/alchemy/materials.py
pymatgen/alchemy/transmuters.py
pymatgen/analysis/adsorption.py
pymatgen/analysis/aflow_prototypes.json
pymatgen/analysis/atomic_subshell_photoionization_cross_sections.csv
pymatgen/analysis/bond_dissociation.py
pymatgen/analysis/bond_valence.py
pymatgen/analysis/bonds_jmol_ob.yaml
pymatgen/analysis/bvparam_1991.yaml
pymatgen/analysis/chempot_diagram.py
pymatgen/analysis/cn_opt_params.yaml
pymatgen/analysis/cost.py
pymatgen/analysis/costdb_elements.csv
pymatgen/analysis/dimensionality.py
pymatgen/analysis/disorder.py
pymatgen/analysis/energy_models.py
pymatgen/analysis/eos.py
pymatgen/analysis/ewald.py
pymatgen/analysis/excitation.py
pymatgen/analysis/fragmenter.py
pymatgen/analysis/functional_groups.py
pymatgen/analysis/graphs.py
pymatgen/analysis/hhi.py
pymatgen/analysis/hhi_data.csv
pymatgen/analysis/icsd_bv.yaml
pymatgen/analysis/interface.py
pymatgen/analysis/interface_reactions.py
pymatgen/analysis/ionic_radii.json
pymatgen/analysis/local_env.py
pymatgen/analysis/molecule_matcher.py
pymatgen/analysis/molecule_structure_comparator.py
pymatgen/analysis/nmr.py
pymatgen/analysis/op_params.yaml
pymatgen/analysis/path_finder.py
pymatgen/analysis/phase_diagram.py
pymatgen/analysis/piezo.py
pymatgen/analysis/piezo_sensitivity.py
pymatgen/analysis/pourbaix_diagram.py
pymatgen/analysis/prototypes.py
pymatgen/analysis/quasiharmonic.py
pymatgen/analysis/reaction_calculator.py
pymatgen/analysis/structure_analyzer.py
pymatgen/analysis/structure_matcher.py
pymatgen/analysis/substrate_analyzer.py
pymatgen/analysis/surface_analysis.py
pymatgen/analysis/thermochemistry.py
pymatgen/analysis/transition_state.py
pymatgen/analysis/vesta_cutoffs.yaml
pymatgen/analysis/wulff.py
pymatgen/analysis/xps.py
pymatgen/analysis/chemenv/__init__.py
pymatgen/analysis/chemenv/connectivity/__init__.py
pymatgen/analysis/chemenv/connectivity/connected_components.py
pymatgen/analysis/chemenv/connectivity/connectivity_finder.py
pymatgen/analysis/chemenv/connectivity/environment_nodes.py
pymatgen/analysis/chemenv/connectivity/structure_connectivity.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/__init__.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/chemenv_strategies.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometry_finder.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/structure_environments.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/voronoi.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/A#2.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/AC#12.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/BO_1#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/BO_2#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/BO_3#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/BS_1#10.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/BS_2#10.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/C#12.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/C#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/CO#11.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/DD#20.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/DD#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/DDPN#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/DI#11.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/ET#7.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/FO#7.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/H#10.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/H#11.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/HA#12.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/HB#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/HD#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/HP#12.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/I#12.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/L#2.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/MI#10.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/O#6.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/O#6_explicit.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/PA#10.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/PB#7.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/PBP#12.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/PCPA#11.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/PP#10.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/PP#5.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/PP#6.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/S#1.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/S#10.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/S#12.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/S#4.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/S#5.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SA#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SBSA#10.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SBT#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SC#12.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SH#11.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SH#13.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SMA#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SS#4.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SS#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/ST#7.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/SY#4.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/T#4.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/T#5.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/T#6.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TBSA#10.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TBT#8.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TC#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TI#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TL#3.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TO_1#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TO_2#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TO_3#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TS#3.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TT#12.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TT_1#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TT_2#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TT_3#9.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/TY#3.json
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/__init__.py
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/coordination_geometries_files/allcg.txt
pymatgen/analysis/chemenv/coordination_environments/strategy_files/ImprovedConfidenceCutoffDefaultParameters.json
pymatgen/analysis/chemenv/utils/__init__.py
pymatgen/analysis/chemenv/utils/chemenv_config.py
pymatgen/analysis/chemenv/utils/chemenv_errors.py
pymatgen/analysis/chemenv/utils/coordination_geometry_utils.py
pymatgen/analysis/chemenv/utils/defs_utils.py
pymatgen/analysis/chemenv/utils/func_utils.py
pymatgen/analysis/chemenv/utils/graph_utils.py
pymatgen/analysis/chemenv/utils/math_utils.py
pymatgen/analysis/chemenv/utils/scripts_utils.py
pymatgen/analysis/diffraction/__init__.py
pymatgen/analysis/diffraction/atomic_scattering_params.json
pymatgen/analysis/diffraction/core.py
pymatgen/analysis/diffraction/neutron.py
pymatgen/analysis/diffraction/neutron_scattering_length.json
pymatgen/analysis/diffraction/tem.py
pymatgen/analysis/diffraction/xrd.py
pymatgen/analysis/elasticity/__init__.py
pymatgen/analysis/elasticity/elastic.py
pymatgen/analysis/elasticity/strain.py
pymatgen/analysis/elasticity/stress.py
pymatgen/analysis/ferroelectricity/__init__.py
pymatgen/analysis/ferroelectricity/polarization.py
pymatgen/analysis/gb/__init__.py
pymatgen/analysis/gb/grain.py
pymatgen/analysis/interfaces/__init__.py
pymatgen/analysis/interfaces/coherent_interfaces.py
pymatgen/analysis/interfaces/substrate_analyzer.py
pymatgen/analysis/interfaces/zsl.py
pymatgen/analysis/magnetism/__init__.py
pymatgen/analysis/magnetism/analyzer.py
pymatgen/analysis/magnetism/default_magmoms.yaml
pymatgen/analysis/magnetism/heisenberg.py
pymatgen/analysis/magnetism/jahnteller.py
pymatgen/analysis/solar/__init__.py
pymatgen/analysis/solar/am1.5G.dat
pymatgen/analysis/solar/slme.py
pymatgen/analysis/structure_prediction/DLS_bond_params.yaml
pymatgen/analysis/structure_prediction/__init__.py
pymatgen/analysis/structure_prediction/dopant_predictor.py
pymatgen/analysis/structure_prediction/substitution_probability.py
pymatgen/analysis/structure_prediction/substitutor.py
pymatgen/analysis/structure_prediction/volume_predictor.py
pymatgen/analysis/structure_prediction/data/lambda.json
pymatgen/analysis/structure_prediction/data/pair_correlation.json
pymatgen/analysis/topological/__init__.py
pymatgen/analysis/topological/spillage.py
pymatgen/analysis/xas/__init__.py
pymatgen/analysis/xas/spectrum.py
pymatgen/apps/__init__.py
pymatgen/apps/battery/__init__.py
pymatgen/apps/battery/analyzer.py
pymatgen/apps/battery/battery_abc.py
pymatgen/apps/battery/conversion_battery.py
pymatgen/apps/battery/insertion_battery.py
pymatgen/apps/battery/plotter.py
pymatgen/apps/borg/__init__.py
pymatgen/apps/borg/hive.py
pymatgen/apps/borg/queen.py
pymatgen/cli/__init__.py
pymatgen/cli/feff_plot_cross_section.py
pymatgen/cli/feff_plot_dos.py
pymatgen/cli/gaussian_analyzer.py
pymatgen/cli/get_environment.py
pymatgen/cli/pmg.py
pymatgen/cli/pmg_analyze.py
pymatgen/cli/pmg_config.py
pymatgen/cli/pmg_plot.py
pymatgen/cli/pmg_potcar.py
pymatgen/cli/pmg_query.py
pymatgen/cli/pmg_structure.py
pymatgen/command_line/OxideTersoffPotentials
pymatgen/command_line/__init__.py
pymatgen/command_line/bader_caller.py
pymatgen/command_line/bush.lib
pymatgen/command_line/chargemol_caller.py
pymatgen/command_line/critic2_caller.py
pymatgen/command_line/enumlib_caller.py
pymatgen/command_line/gulp_caller.py
pymatgen/command_line/lewis.lib
pymatgen/command_line/mcsqs_caller.py
pymatgen/command_line/vampire_caller.py
pymatgen/core/__init__.py
pymatgen/core/bond_lengths.json
pymatgen/core/bonds.py
pymatgen/core/composition.py
pymatgen/core/func_groups.json
pymatgen/core/interface.py
pymatgen/core/ion.py
pymatgen/core/lattice.py
pymatgen/core/libxc_docs.json
pymatgen/core/libxcfunc.py
pymatgen/core/molecular_orbitals.py
pymatgen/core/operations.py
pymatgen/core/periodic_table.json
pymatgen/core/periodic_table.py
pymatgen/core/py.typed
pymatgen/core/quad_data.json
pymatgen/core/reconstructions_archive.json
pymatgen/core/sites.py
pymatgen/core/spectrum.py
pymatgen/core/structure.py
pymatgen/core/surface.py
pymatgen/core/tensors.py
pymatgen/core/trajectory.py
pymatgen/core/units.py
pymatgen/core/xcfunc.py
pymatgen/electronic_structure/__init__.py
pymatgen/electronic_structure/bandstructure.py
pymatgen/electronic_structure/boltztrap.py
pymatgen/electronic_structure/boltztrap2.py
pymatgen/electronic_structure/cohp.py
pymatgen/electronic_structure/core.py
pymatgen/electronic_structure/dos.py
pymatgen/electronic_structure/plotter.py
pymatgen/entries/MITCompatibility.yaml
pymatgen/entries/MP2020Compatibility.yaml
pymatgen/entries/MPCompatibility.yaml
pymatgen/entries/__init__.py
pymatgen/entries/calc_compounds.json.gz
pymatgen/entries/compatibility.py
pymatgen/entries/computed_entries.py
pymatgen/entries/correction_calculator.py
pymatgen/entries/entry_tools.py
pymatgen/entries/exp_compounds.json.gz
pymatgen/entries/exp_entries.py
pymatgen/entries/mixing_scheme.py
pymatgen/entries/data/g_els.json
pymatgen/entries/data/nist_gas_gf.json
pymatgen/ext/cod.py
pymatgen/ext/matproj.py
pymatgen/ext/optimade.py
pymatgen/io/adf.py
pymatgen/io/ase.py
pymatgen/io/atat.py
pymatgen/io/babel.py
pymatgen/io/cif.py
pymatgen/io/core.py
pymatgen/io/cssr.py
pymatgen/io/cube.py
pymatgen/io/fiesta.py
pymatgen/io/gaussian.py
pymatgen/io/jarvis.py
pymatgen/io/lmto.py
pymatgen/io/nwchem.py
pymatgen/io/packmol.py
pymatgen/io/phonopy.py
pymatgen/io/prismatic.py
pymatgen/io/pwscf.py
pymatgen/io/res.py
pymatgen/io/shengbte.py
pymatgen/io/template.py
pymatgen/io/wannier90.py
pymatgen/io/xcrysden.py
pymatgen/io/xr.py
pymatgen/io/xyz.py
pymatgen/io/zeopp.py
pymatgen/io/abinit/__init__.py
pymatgen/io/abinit/abiobjects.py
pymatgen/io/abinit/abitimer.py
pymatgen/io/abinit/inputs.py
pymatgen/io/abinit/netcdf.py
pymatgen/io/abinit/pseudos.py
pymatgen/io/abinit/variable.py
pymatgen/io/cp2k/__init__.py
pymatgen/io/cp2k/inputs.py
pymatgen/io/cp2k/outputs.py
pymatgen/io/cp2k/sets.py
pymatgen/io/cp2k/settings.yaml
pymatgen/io/cp2k/utils.py
pymatgen/io/exciting/__init__.py
pymatgen/io/exciting/inputs.py
pymatgen/io/feff/MPELNESSet.yaml
pymatgen/io/feff/MPEXAFSSet.yaml
pymatgen/io/feff/MPEXELFSSet.yaml
pymatgen/io/feff/MPXANESSet.yaml
pymatgen/io/feff/__init__.py
pymatgen/io/feff/inputs.py
pymatgen/io/feff/outputs.py
pymatgen/io/feff/sets.py
pymatgen/io/lammps/CoeffsDataType.yaml
pymatgen/io/lammps/__init__.py
pymatgen/io/lammps/data.py
pymatgen/io/lammps/inputs.py
pymatgen/io/lammps/outputs.py
pymatgen/io/lammps/utils.py
pymatgen/io/lammps/templates/md.txt
pymatgen/io/lobster/__init__.py
pymatgen/io/lobster/inputs.py
pymatgen/io/lobster/lobsterenv.py
pymatgen/io/lobster/outputs.py
pymatgen/io/lobster/lobster_basis/BASIS_PBE_54_max.yaml
pymatgen/io/lobster/lobster_basis/BASIS_PBE_54_min.yaml
pymatgen/io/lobster/lobster_basis/BASIS_PBE_54_standard.yaml
pymatgen/io/qchem/__init__.py
pymatgen/io/qchem/inputs.py
pymatgen/io/qchem/outputs.py
pymatgen/io/qchem/sets.py
pymatgen/io/qchem/utils.py
pymatgen/io/vasp/MITRelaxSet.yaml
pymatgen/io/vasp/MPAbsorptionSet.yaml
pymatgen/io/vasp/MPHSERelaxSet.yaml
pymatgen/io/vasp/MPRelaxSet.yaml
pymatgen/io/vasp/MPSCANRelaxSet.yaml
pymatgen/io/vasp/MVLGWSet.yaml
pymatgen/io/vasp/MVLRelax52Set.yaml
pymatgen/io/vasp/VASPIncarBase.yaml
pymatgen/io/vasp/__init__.py
pymatgen/io/vasp/help.py
pymatgen/io/vasp/incar_parameters.json
pymatgen/io/vasp/inputs.py
pymatgen/io/vasp/optics.py
pymatgen/io/vasp/outputs.py
pymatgen/io/vasp/sets.py
pymatgen/io/vasp/vasp_potcar_file_hashes.json
pymatgen/io/vasp/vasp_potcar_pymatgen_hashes.json
pymatgen/io/vasp/vdW_parameters.yaml
pymatgen/io/xtb/__init__.py
pymatgen/io/xtb/inputs.py
pymatgen/io/xtb/outputs.py
pymatgen/optimization/__init__.py
pymatgen/optimization/linear_assignment.pyx
pymatgen/optimization/linear_assignment_numpy.py
pymatgen/optimization/neighbors.pyx
pymatgen/phonon/__init__.py
pymatgen/phonon/bandstructure.py
pymatgen/phonon/dos.py
pymatgen/phonon/gruneisen.py
pymatgen/phonon/ir_spectra.py
pymatgen/phonon/plotter.py
pymatgen/phonon/thermal_displacements.py
pymatgen/symmetry/__init__.py
pymatgen/symmetry/analyzer.py
pymatgen/symmetry/bandstructure.py
pymatgen/symmetry/groups.py
pymatgen/symmetry/kpath.py
pymatgen/symmetry/maggroups.py
pymatgen/symmetry/settings.py
pymatgen/symmetry/site_symmetries.py
pymatgen/symmetry/structure.py
pymatgen/symmetry/symm_data.json
pymatgen/symmetry/symm_data.yaml
pymatgen/symmetry/symm_data_magnetic.sqlite
pymatgen/symmetry/symm_ops.json
pymatgen/symmetry/symm_ops.yaml
pymatgen/transformations/__init__.py
pymatgen/transformations/advanced_transformations.py
pymatgen/transformations/site_transformations.py
pymatgen/transformations/standard_transformations.py
pymatgen/transformations/transformation_abc.py
pymatgen/util/__init__.py
pymatgen/util/convergence.py
pymatgen/util/coord.py
pymatgen/util/coord_cython.pyx
pymatgen/util/io_utils.py
pymatgen/util/num.py
pymatgen/util/plotly_chempot_layouts.json
pymatgen/util/plotly_interface_rxn_layouts.json
pymatgen/util/plotly_pd_layouts.json
pymatgen/util/plotting.py
pymatgen/util/provenance.py
pymatgen/util/string.py
pymatgen/util/testing.py
pymatgen/util/typing.py
pymatgen/util/structures/BaNiO3.json
pymatgen/util/structures/CsCl.json
pymatgen/util/structures/Graphite.json
pymatgen/util/structures/He_BCC.json
pymatgen/util/structures/K2O2.json
pymatgen/util/structures/La2CoO4F.json
pymatgen/util/structures/Li10GeP2S12.json
pymatgen/util/structures/Li2O.json
pymatgen/util/structures/Li2O2.json
pymatgen/util/structures/Li3V2(PO4)3.json
pymatgen/util/structures/LiFePO4.json
pymatgen/util/structures/NaFePO4.json
pymatgen/util/structures/Pb2TiZrO6.json
pymatgen/util/structures/Si.json
pymatgen/util/structures/SiO2.json
pymatgen/util/structures/Si_SiO2_Interface.json
pymatgen/util/structures/Sn.json
pymatgen/util/structures/SrTiO3.json
pymatgen/util/structures/TiO2.json
pymatgen/util/structures/TlBiSe2.json
pymatgen/util/structures/VO2.json
pymatgen/vis/ElementColorSchemes.yaml
pymatgen/vis/__init__.py
pymatgen/vis/plotters.py
pymatgen/vis/structure_chemview.py
pymatgen/vis/structure_vtk.py

@janosh janosh changed the title rm MANIFEST.in plus modify setup.py to pull cmd_line/**/* into SOURCE… rm MANIFEST.in Nov 18, 2022
@janosh janosh enabled auto-merge (squash) November 18, 2022 00:15
@coveralls
Copy link

coveralls commented Nov 18, 2022

Coverage Status

Coverage decreased (-36.3%) to 0.0% when pulling 8053a85 on bye-manifest into 58685c4 on master.

@janosh janosh merged commit 77f3361 into master Nov 18, 2022
@janosh janosh deleted the bye-manifest branch November 18, 2022 00:33
Sign up for free to join this conversation on GitHub. Already have an account? Sign in to comment
Labels
None yet
Projects
None yet
Development

Successfully merging this pull request may close these issues.

2 participants